Hanya beberapa masaalah keselamatan telah dikenalpasti dalam rujukan perlaksanaan pengkalan kod NTP dalam sejarah 25+ tahunnya.[6][7]

NTP sendiri telah melalui beberapa semakan dan ia sendiri telah di semak dan kajian semula sepanjang sejarahnya, dan tiada kelemahan keselamatan pernah dilaporkan dijejak langsung kepada spesifikasi NTP.[8]

Pengkalan kod semasa bagi rujukan perlaksanaan sedang melalui audit keselamatan dari beberapa sumber untuk beberapa tahun kini, dan tidak terdapat kelemahan berisiko tinggi dalam aturcara yang dibebaskan kini.[9]

Terdapat bahaya yang dibayangkan dengan pengiraan aliran masa NTP4 64-bit kini sepanjang era. Ia mungkin menghadapai set keadaan timbul pada 2036 yang mungkin menyebabkan masa terlebih laksana atau gelung sekitar peristiwa.